俗稱「大腸鏡」的結腸內視鏡檢查，是用一條柔軟的內視鏡經肛門進入身體來檢查下消化道的內壁狀況（如有沒有息肉、腫瘤或炎症狀況），檢查部位包括迴腸末端、盲腸、結腸（升、橫、降及乙狀）、直腸及肛門。在公營醫院進行時會注射適量鎮靜劑，但病人有機會仍處於清醒狀態。在私家醫院內，大腸鏡大多在靜脈注射鎮靜劑或麻醉監察下進行。檢查時間一般大約十五至三十分鐘，但如遇上複雜的情況，則治療時間可以更長。

常見接受大腸鏡檢查的原因:

• 大便出血
• 大便檢測有隱血
• 大便習慣改變 （便秘或腹瀉、糞便變幼、排便後還有便意）
• 腹部不適 （尤其下腹痛或脹）
• 貧血
• 有結腸癌家族史

大腸鏡除了有診斷的作用外亦可進行治療性的程序如抽取組織化驗、息肉切除、控制出血、擴張腸道及放置支架等。

檢查大腸鏡的前三天必須進食低纖維餐（避免進食生果蔬菜等），檢查前一天只可飲用清流質（如清湯、粥水，奶類飲品除外），另外需服用二至四公升的瀉藥（服用方法因應不同醫生及病人會作適當調整），將腸道完全清潔，避免糞便影響檢測結果。如患有糖尿病、高血壓或懷孕等情況，須告知醫護人員以作特別安排。病人不宜親自駕駛，亦應避免檢查前酗酒、抽煙或服用不當份量的鎮靜藥物。

檢查後，注射藥物的效力會持續一段時間，待藥力減退後方可飲食。病者的意識、記憶及思考能力會受藥物影響，故此最好在親友陪同下聽取檢查情況及離開回家休息，不要駕駛及簽署法律文件。

結腸鏡檢查一般來說都是一個安全度高的檢查，部分病者可能會在檢查後感到腹部氣脹及頭暈不適，這屬正常現象，稍作休息情況便可改善。其他較嚴重但罕見的併發症包括下消化道流血或穿破、心肺併發症、藥物敏感等，惟機會一般少於千分之一。若需接受治療性程序（如息肉切除或擴張腸道等），嚴重併發症的風險則會增加。若檢查後遇上嚴重症狀（出血、腹部劇痛、發燒等），則應盡快求醫。